L'exploitation de Fontaines, située dans l'EPLEFPA Fontaines Sud Bourgogne, met en valeur une surface d'environ 145 hectares, dont 100 hectares de prairies et est orientée vers l'élevage. Elle accueille ainsi un atelier vaches laitières (75 vaches Montbéliardes), un atelier bovin viande (20 vaches Charolaises), un atelier avicole comprenant des volailles de chair (poulets, pintades, chapons), des poules pondeuses plein air, ainsi qu'un rucher pédagogique (10 ruches).

La Boutique du Lycée Agricole de Fontaines met en vente des produits des lycées agricoles publics de Fontaines, de Charolles et d'autres exploitations de lycées agricoles publics régionaux et nationaux (Beaune, Mâcon, Plombières, Poligny, Bourg en Bresse, Périgueux, Avize...). Activités pédagogiques et de découverte : accueil de classes maternelles, primaires, collèges ... Programme fermes ouvertes de la chambre d'agriculture.

Productions de la ferme : Viandes Bovines, viandes de Volailles, Lait Cru, Oeufs, miel L'exploitation est certifiée HVE* (Haute Valeur Environnementale) depuis Septembre 2021